تركز المرحلة الثانية من التدريب على اكتساب المتدرب لمهارات وأدوات التقييم والتشخيص من خلال استخدام أدوات متخصصة في المجالات المعرفية والسلوكية، إضافة  إلى عرض نبذة مفصلة عن مؤشرات الأداء المعرفي، والانفعالي، والاجتماعي، والجسدي، وتعتبر هذه المرحلة أساسية في استخدام النسخة العربية من مقياس لايتر-3 الأدائي العالمي لأنها تساعد على تقييم القدرات المعرفية والعصبية وتقييم الذاكرة غير اللفظية والانتباه والتداخل المعرفي لدى الأطفال والمراهقين والبالغين.

كما ستشتمل هذه المرحلة، التدريب على مقياس تقييم السلوك التكيفي، والقائمة المرجعية لاضطراب طيف التوحد (CASD)، إضافة إلى التدريب على مقياس اضطراب فرط الحركة وتشتت الانتباه.

تستند جميع المقاييس السلوكية إلى الدليل التشخيصي والإحصائي للاضطرابات العقلية DSM-5 وستكون الاعتبارات الأخلاقية والمهنية في التشخيص والتقييم عنصراً أساسياً في هذه المرحلة.

بعد الانتهاء من التدريب، ستنفذ خطة المتابعة بمعدل 8 ساعات عملية لكل متدرب، حيث يتوقع من كل متدرب أن يطبق الأدوات على ثلاثة من المفحوصين.

 تبدأ خطة المتابعة بعقد اجتماع لمدة ساعتين واحدة تلو الأخرى بين المدرب والمتدرب، يتم خلالها استعراض الجوانب التقنية لعملية تطبيق الأداة ومناقشتها، يليها اجتماع لمدة ساعتين بين المدرب والمتدرب بعد الإنتهاء من تطبيق الأدوات على أحد المفحوصين. 

وبعد تطبيق الأدوات على المفحوصين الثلاثة، يجتمع المدرب والمتدرب لمدة ساعتين لمناقشة مجموعة من الحالات الافتراضية التي يمكن أن تحدث عند تطبيق الأدوات. وفي نهاية خطة المتابعة، سيجتمع المدربون مع كل متدرب لمدة ساعتين لتقديم تعليقات بشأن عملية المتابعة بأكملها.